ใช้เป็นสารกลางสำคัญในปฏิกิริยาการจับคู่ข้ามของ Suzuki-Miyaura ซึ่งช่วยให้สามารถสังเคราะห์โมเลกุลอินทรีย์ที่ซับซ้อน โดยเฉพาะในอุตสาหกรรมเภสัชกรรมและเกษตรเคมี โครงสร้างเอสเตอร์บอโรเนตของเอสเตอร์นีโอเพนทิลไกลคอลช่วยเพิ่มความเสถียรและการจัดการเมื่อเทียบกับกรดบอโรนิกอิสระ ทำให้เหมาะสำหรับการใช้งานในระดับใหญ่ ใช้กันทั่วไปในการเตรียมสารประกอบชีวภาพ รวมถึงยาตัวสมัครที่มีโครงสร้าง biaryl หรือ aryl-heteroaryl หมู่เมทอกซีและไซยาโนช่วยให้สามารถทำการฟังก์ชันนาไลเซชันเพิ่มเติมหรือทำหน้าที่เป็นกลุ่มนำทางในปฏิกิริยาต่อไป