N-Bocamino-cyano-acetic acid ethyl ester ถูกนำมาใช้อย่างกว้างขวางในกระบวนการสังเคราะห์สารเคมี โดยเฉพาะในด้านการสร้างเปปไทด์และโมเลกุลทางชีวภาพ เนื่องจากมีกลุ่ม Boc (tert-butoxycarbonyl) ที่ช่วยในการป้องกันกลุ่มเอมีนระหว่างการสังเคราะห์ ทำให้สามารถควบคุมการเกิดปฏิกิริยาได้อย่างแม่นยำ นอกจากนี้ยังใช้เป็นสารตั้งต้นในการผลิตสารประกอบที่มีโครงสร้างซับซ้อน เช่น ยาและสารออกฤทธิ์ทางชีวภาพ เนื่องจากโครงสร้างที่มีทั้งกลุ่มไซยาโนและเอสเตอร์ช่วยให้เกิดความหลากหลายในการปรับเปลี่ยนโครงสร้างทางเคมี