ไบโอติน-PEG3-มาไลอิมายด์ถูกใช้อย่างแพร่หลายในการเชื่อมต่อทางชีวภาพและการวิจัยทางชีวเคมี มันทำหน้าที่เป็นลิงเกอร์ที่หลากหลายสำหรับการติดไบโอตินกับโปรตีน เปปไทด์ หรือโมเลกุลชีวภาพอื่นๆ ทำให้สามารถตรวจจับหรือทำให้บริสุทธิ์ผ่านปฏิกิริยาสเตรปตาวิดิน-ไบโอติน กลุ่มมาไลอิมายด์ช่วยให้เกิดการเชื่อมต่อเฉพาะเจาะจงกับกลุ่มไทออล (-SH) ในกรดอะมิโนซิสเตอีน ทำให้เกิดการติดฉลากที่แม่นยำและเสถียร สารประกอบนี้มีคุณค่าอย่างยิ่งในการพัฒนาระบบการส่งยาแบบกำหนดเป้าหมาย การทดสอบวินิจฉัย และเทคนิคการถ่ายภาพโมเลกุล พื้นที่ PEG ช่วยเพิ่มความละลายและลดการขัดขวางเชิง steric ทำให้ประสิทธิภาพของกระบวนการไบโอตินิเลชันดีขึ้น นักวิจัยยังใช้มันในการศึกษาการโต้ตอบระหว่างโปรตีน การติดฉลากพื้นผิวเซลล์ และการพัฒนาโพรบที่ติดไบโอตินสำหรับการประยุกต์ใช้ทางวิเคราะห์ต่างๆ