4-Propargyloxy-L-phenylalanine ถูกนำมาใช้ในการวิจัยทางชีวเคมีและเภสัชวิทยา โดยเฉพาะในการศึกษาปฏิกิริยาเคมีแบบคลิกเคมี (click chemistry) ซึ่งเป็นเทคนิคที่ใช้ในการเชื่อมโยงโมเลกุลต่าง ๆ เข้าด้วยกันอย่างมีประสิทธิภาพ สารนี้มักใช้เป็นสารตั้งต้นในการสังเคราะห์สารประกอบที่มีฤทธิ์ทางชีวภาพ เช่น ยาและสารออกฤทธิ์ทางชีวภาพอื่น ๆ นอกจากนี้ยังมีการนำไปใช้ในการพัฒนายาเพื่อรักษาโรคต่าง ๆ รวมถึงการศึกษากลไกการทำงานของเอนไซม์และโปรตีนในร่างกาย