Propargyl-PEG6-N3 ถูกใช้อย่างแพร่หลายในการ bioconjugation และ click chemistry เนื่องจากลักษณะ bifunctional ของมัน กลุ่ม azide ช่วยให้เกิดปฏิกิริยาที่มีประสิทธิภาพและเลือกสรรกับ alkynes ทำให้มีคุณค่าในการ labeling biomolecules เช่น โปรตีน เพปไทด์ และแอนติบอดี Spacer PEG ช่วยเพิ่มความสามารถในการละลายและลด steric hindrance ปรับปรุงประสิทธิภาพปฏิกิริยาในสภาพแวดล้อมน้ำ สารประกอบนี้มีประโยชน์โดยเฉพาะในระบบการส่งยา ที่ซึ่งมันช่วยในการติดยา therapeutic กับโมเลกุล targeting นอกจากนี้ยังมีบทบาทในวิทยาศาสตร์วัสดุสำหรับการปรับแต่งพื้นผิวและ functionalization ของ nanoparticles หรือ polymers ความยืดหยุ่นของมันยังขยายไปถึงการศึกษาชีวฟิสิกส์ ที่ซึ่งช่วยในการพัฒนา fluorescent probes และ imaging agents ใช้ในการสังเคราะห์โมเลกุลทางเคมีที่มีความซับซ้อน โดยเฉพาะในกระบวนการ Click Chemistry ซึ่งเป็นเทคนิคที่ใช้ในการเชื่อมโยงโมเลกุลต่าง ๆ เข้าด้วยกันอย่างมีประสิทธิภาพ เนื่องจากมีกลุ่มฟังก์ชัน azide (N3) และ alkyne (propargyl) ที่สามารถทำปฏิกิริยา cycloaddition ได้อย่างรวดเร็วและเฉพาะเจาะจง นอกจากนี้ยังถูกนำไปใช้ในการปรับแต่งพื้นผิวของวัสดุ การสร้างชีววัสดุ และการพัฒนายา โดยเฉพาะในด้านการส่งยาและการวินิจฉัยโรค เนื่องจาก PEG (polyethylene glycol) ช่วยเพิ่มความเสถียรและความสามารถในการละลายของสารประกอบ