Isopropyl 4,4,4-trifluoroacetoacetate ใช้กันอย่างแพร่หลายในการสังเคราะห์อินทรีย์ในฐานะบล็อกก่อสร้างที่หลากหลายสำหรับการเตรียมสารประกอบฟลูออรีนที่หลากหลาย กลุ่ม trifluoromethyl ของมันช่วยเพิ่มปฏิกิริยาและความเสถียรของสารกลาง ทำให้มีคุณค่าต่อการสังเคราะห์ยาเคมีเกษตร และสารเคมีพิเศษ โดยเฉพาะอย่างยิ่งมีประโยชน์ในการผลิตฮีเทอโรไซเคิลฟลูออรีน ซึ่งเป็นส่วนประกอบหลักในการพัฒนายา นอกจากนี้ยังทำหน้าที่เป็นสารตั้งต้นในการสังเคราะห์โพลิเมอร์ฟลูออรีนและสารเคลือบ ซึ่งให้ความต้านทานทางเคมีและความทนทานที่ดียิ่งขึ้น การประยุกต์ใช้ของมันขยายไปสู่สาขาวิทยาศาสตร์วัสดุ ซึ่งมีส่วนช่วยในการพัฒนาวัสดุขั้นสูงที่มีคุณสมบัติเฉพาะตัว