(2-Fluoro-4-methoxyphenyl)methanamine hydrochloride ถูกนำมาใช้ในงานวิจัยทางเคมีและเภสัชวิทยาเพื่อพัฒนายาใหม่ โดยเฉพาะในด้านการออกแบบและสังเคราะห์สารประกอบที่มีศักยภาพในการรักษาโรคทางระบบประสาท เช่น โรคซึมเศร้าและโรควิตกกังวล เนื่องจากโครงสร้างทางเคมีที่มีทั้งกลุ่มฟลูออโรและเมทอกซี ซึ่งอาจส่งผลต่อการจับกับตัวรับในสมอง นอกจากนี้ ยังมีการศึกษาการนำสารนี้ไปใช้ในการพัฒนายาต้านจุลชีพหรือสารต้านอนุมูลอิสระ เนื่องจากคุณสมบัติทางเคมีที่อาจช่วยยับยั้งการเจริญเติบโตของเชื้อโรคหรือลดการเกิดออกซิเดชันในร่างกาย อย่างไรก็ตาม การใช้งานยังอยู่ในขั้นตอนการวิจัยและทดลองทางคลินิกเพื่อประเมินประสิทธิภาพและความปลอดภัย