3-Methoxybenzylamine ใช้อย่างแพร่หลายในการสังเคราะห์ยา โดยเฉพาะในการผลิตสารประกอบที่มีศักยภาพในการรักษา มันทำหน้าที่เป็นสารตั้งต้นสำคัญในการพัฒนายาที่มุ่งเป้าไปที่ความผิดปกติทางระบบประสาท เช่น ยาต้านซึมเศร้าและยาลดความวิตกกังวล เนื่องจากโครงสร้างที่เข้ากันได้กับโมเลกุลชีวภาพ นอกจากนี้ ยังใช้ในการเตรียมสารเคมีเกษตร เช่น ยาฆ่าแมลงและสารกำจัดวัชพืช ซึ่งคุณสมบัติทางเคมีของมันช่วยเพิ่มประสิทธิภาพของส่วนผสมที่ออกฤทธิ์ ในสาขาเคมีอินทรีย์ มันถูกใช้เป็นส่วนประกอบพื้นฐานในการสังเคราะห์โมเลกุลที่ซับซ้อน รวมถึงสีย้อม น้ำหอม และสารเคมีเฉพาะทาง ความหลากหลายและปฏิกิริยาของมันทำให้เป็นส่วนประกอบที่มีคุณค่าต่อการวิจัยและการประยุกต์ใช้ในอุตสาหกรรม