(2,6-Dichlorobenzyl)methylamine hydrochloride ถูกใช้หลักๆ ในสาขาการสังเคราะห์อินทรีย์ โดยทำหน้าที่เป็นสารกลางสำคัญในการผลิตยาต่างๆ โครงสร้างของมันมีคุณค่าในการสร้างโมเลกุลที่มีศักยภาพในการรักษา โดยเฉพาะอย่างยิ่งในการพัฒนายาที่มุ่งเป้าไปที่ระบบประสาทส่วนกลาง นอกจากนี้ ยังมีการนำไปใช้ในงานวิจัยเพื่อศึกษากลไกทางชีวเคมีและปฏิกิริยาของตัวรับ ซึ่งช่วยในการค้นพบสารยารักษาใหม่ บทบาทของมันในการสังเคราะห์เคมีมักเกี่ยวข้องกับการปรับแต่งเพื่อเพิ่มประสิทธิภาพและความจำเพาะของยา