N-Ethyl-4-fluorobenzylamine ถูกนำมาใช้ในการสังเคราะห์ยาต่างๆ โดยเฉพาะในการพัฒนาส่วนประกอบยาที่มีฤทธิ์ทางเภสัชวิทยาหลัก (APIs) ที่มุ่งเป้าไปยังความผิดปกติทางระบบประสาท สารนี้ทำหน้าที่เป็นสารกลางสำคัญในการผลิตสารประกอบที่โต้ตอบกับระบบสื่อประสาท ทำให้มีคุณค่าต่อการสร้างยารักษาโรค เช่น ภาวะซึมเศร้า ความวิตกกังวล และอาการปวดเรื้อรัง นอกจากนี้ ยังถูกนำมาใช้ในการวิจัยทางเคมีอินทรีย์สำหรับการพัฒนาสารเคมีใหม่ที่มีศักยภาพในการบำบัดทางการแพทย์ ผู้แทนฟลูออรีนของมันช่วยเพิ่มกิจกรรมทางชีวภาพและความเสถียรทางเมแทบอลิซึมของโมเลกุลที่ได้ ทำให้เป็นตัวเลือกที่ชื่นชอบในเคมียารักษาโรค