3-Chloro-4-fluorobenzylamine ถูกนำไปใช้อย่างแพร่หลายในอุตสาหกรรมเภสัชกรรมในฐานะสารตั้งต้นสำคัญในการสังเคราะห์ส่วนประกอบยาสำคัญ (APIs) ต่างๆ โครงสร้างของมันช่วยให้ทำหน้าที่เป็นส่วนประกอบพื้นฐานในการพัฒนายาที่มุ่งเป้าไปที่ความผิดปกติทางระบบประสาท รวมถึงยาต้านซึมเศร้าและยารักษาโรคจิต นอกจากนี้ ยังถูกนำไปใช้ในการผลิตสารเคมีเกษตร โดยเฉพาะในการสังเคราะห์สารกำจัดวัชพืชและยาฆ่าแมลง ซึ่งวงแหวนอะโรมาติกที่มีฮาโลเจนช่วยเพิ่มกิจกรรมทางชีวภาพของผลิตภัณฑ์สุดท้าย ในด้านวิทยาศาสตร์วัสดุ มันทำหน้าที่เป็นสารตั้งต้นในการสร้างโพลิเมอร์พิเศษและสารเคลือบผิว ซึ่งให้ความต้านทานต่อสารเคมีและความทนทานที่ดียิ่งขึ้น ความหลากหลายของมันยังขยายไปสู่การสังเคราะห์อินทรีย์ ซึ่งถูกนำไปใช้ในการเตรียมโมเลกุลซับซ้อนสำหรับการวิจัยและการประยุกต์ใช้ในอุตสาหกรรม