3,4,5-Trifluorobenzylamine ถูกใช้เป็นสารกลางสำคัญในการสังเคราะห์เภสัชภัณฑ์ โดยเฉพาะในการพัฒนาสารออกฤทธิ์ทางเภสัชกรรม (APIs) สำหรับยาที่มุ่งเป้าไปยังโรคระบบประสาทส่วนกลาง นอกจากนี้ ยังใช้ในการผลิตสารเคมีเกษตร โดยทำหน้าที่เป็นส่วนประกอบพื้นฐานสำหรับสารกำจัดวัชพืชและยาฆ่าแมลง นอกจากนั้น ยังมีการประยุกต์ใช้ในวิทยาศาสตร์วัสดุ เพื่อช่วยในการสร้างโพลิเมอร์และสารเคลือบขั้นสูงที่มีคุณสมบัติปรับปรุงแล้ว กลุ่ม trifluoro บนเบนซีนริงทำให้มีลักษณะเฉพาะที่เป็นประโยชน์ในการสังเคราะห์อินทรีย์สำหรับปรับโครงสร้างเคมีเพื่อให้ได้ปฏิกิริยาและความเสถียรที่ต้องการ