(2-Fluoro-4-nitrophenyl)methanamine hydrochloride ถูกนำมาใช้หลักในงานวิจัยและพัฒนายาเภสัชกรรมเป็นสารตั้งต้นสำหรับการสังเคราะห์สารประกอบอินทรีย์ที่ซับซ้อน เป็นสารกลางสำคัญในการสร้างส่วนประกอบยาสำคัญทางเภสัชกรรม (APIs) ต่างๆ โดยเฉพาะอย่างยิ่งที่มุ่งเป้าไปยังตัวรับหรือเอนไซม์เฉพาะในร่างกาย โครงสร้างของมันซึ่งมีทั้งกลุ่มฟลูออโรและไนโตร ทำให้มีคุณค่าต่อการออกแบบโมเลกุลที่มีความสามารถในการจับติดสูงขึ้นและมีความเลือกสรร นอกจากนี้ ยังถูกนำมาใช้ในการพัฒนาโพรบเรืองแสงและสีย้อมสำหรับการทดสอบทางชีวเคมี ช่วยในการศึกษากระบวนการในเซลล์และปฏิกิริยาระหว่างโมเลกุล การประยุกต์ใช้ขยายไปยังวิทยาศาสตร์วัสดุ ซึ่งใช้ในการปรับเปลี่ยนพื้นผิวหรือสร้างโพลิเมอร์เฉพาะทางที่มีคุณสมบัติพิเศษ