ใช้เป็นสารกลางในกระบวนการสังเคราะห์สารอินทรีย์ โดยเฉพาะในการเตรียมยาและสารเคมีละเอียด กลุ่มคลอไรด์ที่ทำปฏิกิริยาได้ช่วยให้เกิดปฏิกิริยาการแทนที่นิวคลีโอฟิลิก ซึ่งช่วยในการนำหมู่ 4-(benzyloxy)benzyl เข้าสู่โมเลกุลที่ใหญ่กว่า นิยมใช้ในการสังเคราะห์ยาต้านไวรัสและยาต้านมะเร็ง เนื่องจากทำหน้าที่เป็นส่วนประกอบพื้นฐานสำหรับโครงสร้างที่ซับซ้อนมากขึ้น ยังใช้ในการพัฒนาเบนซิลเดริวาทิวที่ได้รับการป้องกันสำหรับใช้ในเคมีเปปไทด์และเคมีคาร์โบไฮเดรต กลุ่มเบนซิลออกซีทำหน้าที่เป็นกลุ่มป้องกันสำหรับฟีนอล ซึ่งช่วยให้เกิดปฏิกิริยาที่เลือกเฉพาะในกระบวนการสังเคราะห์หลายขั้นตอน