ใช้เป็นตัวกลางสำคัญในการสังเคราะห์ยา โดยเฉพาะในการพัฒนาสารเคมีเกษตรและโมเลกุลที่มีฤทธิ์ทางชีวภาพ หมู่โบรโมเมทิลช่วยให้สามารถจับคู่กับนิวคลีโอไฟล์ได้ง่าย ทำให้มีคุณค่าในการสร้างสารประกอบอินทรีย์ที่ซับซ้อน นิยมใช้ในการเตรียมอนุพันธ์ฟลูออรีนของผลิตภัณฑ์จากธรรมชาติเพื่อเพิ่มความเสถียรทางเมแทบอลิซึมและลิโพฟิลิก นอกจากนี้ยังใช้ในเคมียารักษาเพื่อนำหมู่ difluoromethoxybenzyl เข้าสู่ยาที่มุ่งเป้าไปที่โรคระบบประสาทส่วนกลางและโรคอักเสบ