3-Fluorobenzyl alcohol ถูกใช้อย่างแพร่หลายเป็นสารกลางในการสังเคราะห์สารประกอบเภสัชกรรมต่างๆ โครงสร้างของมันช่วยให้เป็นส่วนประกอบหลักสำคัญในการผลิตยา โดยเฉพาะยาที่มุ่งเป้าไปยังโรคทางระบบประสาทและจิตเวช มันยังถูกนำมาใช้ในการพัฒนาสารเคมีเกษตร ซึ่งมีส่วนช่วยในการสร้างยาฆ่าแมลงและสารกำจัดวัชพืช นอกจากนี้ สารประกอบนี้ยังถูกใช้ในการวิจัยเคมีอินทรีย์สำหรับการเตรียมโมเลกุลฟลูออรีนที่ซับซ้อนมากขึ้น ซึ่งมีคุณค่าในวิทยาศาสตร์วัสดุและเคมียารักษาโรค การประยุกต์ใช้ของมันขยายไปยังสาขาเคมีละเอียด ซึ่งใช้ในการผลิตสารเคมีพิเศษและสีย้อม