ใช้เป็นสารตั้งต้นในการสังเคราะห์สารประกอบทางเภสัชกรรม โดยเฉพาะในกลุ่มยาที่มีฤทธิ์ต่อระบบประสาทส่วนกลาง เช่น ยาต้านอาการซึมเศร้าและวิตกกังวล นอกจากนี้ยังถูกนำไปใช้ในงานวิจัยด้านเคมีอินทรีย์เพื่อสร้างสารนำร่อง (lead compound) สำหรับพัฒนายาใหม่ เนื่องจากโครงสร้างที่มีเบนโซไทโอฟีนทำให้มีคุณสมบัติในการละลายในไขมันดี และสามารถผ่านเยื่อหุ้มเซลล์ได้ง่าย จึงเหมาะสำหรับการพัฒนายาที่ต้องการออกฤทธิ์ภายในเซลล์