ใช้เป็นสารตัวกลางสำคัญในการสังเคราะห์ยา โดยเฉพาะในการพัฒนาโมเลกุลที่มีฤทธิ์ทางชีวภาพและสารประกอบเฮเทโรไซคลิก กลุ่มฟังก์ชันอัลดีไฮด์ช่วยให้สามารถปรับแต่งได้ง่ายผ่านปฏิกิริยาการควบแน่นหรือการรีดักชัน ทำให้มีคุณค่าในการสร้างโครงสร้างอินทรีย์ที่ซับซ้อน ใช้กันทั่วไปในการเตรียมยาต้านมะเร็ง ยาต้านจุลชีพ และตัวยับยั้งคินาส เนื่องจากแกนเบนโซไทโอเฟนที่พบมากในเคมียารักษาโรค นอกจากนี้ยังใช้ในการวิจัยสารเคมีเกษตรสำหรับออกแบบยาฆ่าแมลงและวัชยาใหม่ ส่วนที่เป็นโบรมีนช่วยให้สามารถฟังก์ชันนาไลซ์เพิ่มเติมผ่านปฏิกิริยาการจับคู่ข้าม เช่น Suzuki หรือ Heck couplings ซึ่งขยายประโยชน์ในการค้นพบยาและวิทยาศาสตร์วัสดุ