ใช้ในการสังเคราะห์สีย้อมเรืองแสงและโปรบ เนื่องจากมีกลุ่มคลอโรเมทิลที่ทำปฏิกิริยาได้ง่าย ซึ่งเกิดการแทนที่กับนิวคลีโอไฟล์ได้รวดเร็ว มักใช้ในการติดฉลากไบโอโมเลกุลสำหรับการถ่ายภาพในงานวิจัยทางชีวภาพ นอกจากนี้ยังใช้เป็นสารกลางในการเตรียมยาและสารเคมีเกษตร โดยแกนเบนโซไทอะโซลมีส่วนช่วยในการออกฤทธิ์ทางชีวภาพ ความสามารถในการสร้างคอนจูเกตที่เสถียรทำให้มีคุณค่าในการพัฒนาเซ็นเซอร์และตัวตรวจวินิจฉัย