ใช้เป็นสารตั้งต้นสำคัญในการสังเคราะห์ยา โดยเฉพาะในการพัฒนายาพื้นฐานซัลโฟนาไมด์ที่มีคุณสมบัติต้านจุลชีพและต้านการอักเสบ นอกจากนี้ยังใช้ในการเตรียมสารเคมีเกษตร เช่น ยาฆ่าหญ้าและยาฆ่าเชื้อรา เนื่องจากความสามารถในการปรับเปลี่ยนโมเลกุลที่มีฤทธิ์ทางชีวภาพ หมู่ซัลโฟนิลคลอไรด์ของมันทำปฏิกิริยากับอะมีนและแอลกอฮอลได้ง่าย ทำให้มีคุณค่าในการสังเคราะห์อินทรีย์เพื่อนำหมู่เบนโซไทอะซอลซัลโฟเนตเข้าไปในสารประกอบขนาดใหญ่ นอกจากนี้ยังใช้ในการสร้างสีย้อมและโพรบเรืองแสงสำหรับการถ่ายภาพทางชีวภาพ โดยอาศัยคุณสมบัติการเรืองแสงโดยธรรมชาติของวงแหวนเบนโซไทอะซอล