ใช้เป็นสารตั้งต้นในกระบวนการสังเคราะห์ยาและสารเคมีเกษตร โดยเฉพาะในการพัฒนาสารชีวภาพที่มีฤทธิ์ต้านจุลชีพ ต้านเชื้อรา ต้านการอักเสบ และต้านมะเร็ง หมู่โบรมีนและหมู่คาร์บอกซิลิกช่วยให้เกิดปฏิกิริยาต่อได้ง่าย เช่น การแทนที่นิวคลีโอไฟล์หรือการสร้างเอไมด์ จึงเหมาะสำหรับการปรับเปลี่ยนโครงสร้างในห้องปฏิบัติการ โครงสร้างเบนโซไทอะโซลทำหน้าที่เป็นตัวตั้งต้นสำคัญในเคมีเฮเทอโรไซคลิก ช่วยในการสร้างสารประกอบออร์แกนิกเชิงซ้อน ใช้บ่อยในเคมียารักษาเพื่อการดัดแปลงโครงสร้างให้มี affinity และ selectivity ในการจับเป้าหมายที่ดีขึ้น นอกจากนี้ยังใช้ในการเตรียมโพรบเรืองแสงและวัสดุออปโตอิเล็กทรอนิกส์ เนื่องจากคุณสมบัติทางอิเล็กทรอนิกส์โดยธรรมชาติของแกนเบนโซไทอะโซล