2-คลอโร-5-ฟลูออโรเบนโซไทอะซอล ถูกใช้หลักในการสังเคราะห์อินทรีย์เป็นสารตั้งต้นที่หลากหลายสำหรับการพัฒนายาและสารเคมีเกษตรต่างๆ โครงสร้างที่เป็นเอกลักษณ์ของมันช่วยให้ทำหน้าที่เป็นส่วนประกอบพื้นฐานในการสร้างสารประกอบที่มีศักยภาพทางชีวภาพ ในเคมียารักษา มันมักถูกนำมาใช้ในการสังเคราะห์โมเลกุลที่อาจแสดงคุณสมบัติต้านจุลชีพ ต้านไวรัส หรือต้านมะเร็ง นอกจากนี้ ยังมีการประยุกต์ใช้ในการผลิตสีย้อมและเม็ดสี เนื่องจากความสามารถในการสร้างโครงสร้างที่เสถียรและซับซ้อน บทบาทของมันในงานวิจัยและพัฒนามีความสำคัญ โดยเฉพาะในการสำรวจตัวแทนบำบัดใหม่และวัสดุฟังก์ชันนัล