5-Bromo-3-fluoro-2-methoxybenzonitrile เป็นสารเคมีที่ใช้ในอุตสาหกรรมเภสัชกรรมและเคมีเกษตรอย่างกว้างขวาง ในด้านเภสัชกรรม สารนี้มักถูกนำมาใช้เป็นสารตั้งต้นในการสังเคราะห์ยาชนิดต่าง ๆ โดยเฉพาะยาที่มีฤทธิ์ต้านการอักเสบหรือยาต้านมะเร็ง เนื่องจากโครงสร้างทางเคมีที่สามารถทำปฏิกิริยาได้หลากหลาย ทำให้สามารถปรับเปลี่ยนเพื่อเพิ่มประสิทธิภาพของยาได้ ในด้านเคมีเกษตร สารนี้ถูกใช้ในการพัฒนาสารกำจัดศัตรูพืชหรือสารป้องกันเชื้อรา เนื่องจากมีความเสถียรทางเคมีสูงและสามารถออกฤทธิ์ได้อย่างมีประสิทธิภาพ นอกจากนี้ยังมีการศึกษาการนำสารนี้ไปใช้ในกระบวนการสังเคราะห์สารเคมีอื่น ๆ ที่มีความซับซ้อนมากขึ้นในห้องปฏิบัติการวิจัยอีกด้วย