5-Chloro-2-nitrobenzonitrile ถูกใช้หลักในการสังเคราะห์ยาและสารเคมีเกษตรต่างๆ เนื่องจากมีกลุ่มไนไตรล์และไนโตรที่ทำปฏิกิริยาได้ มันทำหน้าที่เป็นสารกลางสำคัญในการผลิตสารกำจัดวัชพืชและยาฆ่าเชื้อรา ซึ่งช่วยปกป้องพืชผลจากศัตรูพืชและโรค นอกจากนี้ยังใช้ในการสังเคราะห์อินทรีย์เพื่อสร้างโมเลกุลซับซ้อนสำหรับการวิจัยและการประยุกต์ใช้ในอุตสาหกรรม โครงสร้างที่มีคลอรีนทำให้มีคุณค่าในการพัฒนาสารประกอบที่มีกิจกรรมทางชีวภาพเฉพาะ