3-Chloro-2,4-difluorobenzonitrile ใช้หลักๆ เป็นสารกลางในการสังเคราะห์ยาและสารเคมีเกษตร โครงสร้างของมันช่วยให้สามารถปรับแต่งเพิ่มเติมได้ ทำให้มีคุณค่าในการพัฒนาสารออกฤทธิ์สำหรับยาและยาฆ่าแมลง ในด้านการวิจัยเภสัชกรรม มันทำหน้าที่เป็นบล็อกพื้นฐานสำหรับสารประกอบที่มุ่งเป้าไปยังพื้นที่บำบัดต่างๆ ในด้านการเกษตร มันมีส่วนช่วยในการสร้างสารกำจัดวัชพืชและยาฆ่าแมลง เพิ่มการป้องกันพืช โครงสร้างอะโรมาติกที่มีฮาโลเจนที่เป็นเอกลักษณ์ยังทำให้เหมาะสำหรับใช้ในวิทยาศาสตร์วัสดุ โดยเฉพาะในการพัฒนาโพลิเมอร์พิเศษและสารเคลือบผิว