3-Amino-5-chlorobenzonitrile ถูกนำมาใช้อย่างกว้างขวางในอุตสาหกรรมเคมี โดยเฉพาะในกระบวนการสังเคราะห์สารเคมีที่มีความซับซ้อน มักใช้เป็นสารตั้งต้นในการผลิตสารออกฤทธิ์ทางยา เช่น ยาต้านมะเร็งและยาต้านจุลชีพ เนื่องจากโครงสร้างที่มีทั้งกลุ่มอะมิโนและไนไตรล์ช่วยให้เกิดปฏิกิริยาที่หลากหลาย นอกจากนี้ ยังถูกนำไปใช้ในการสังเคราะห์สารเคมีเกษตร เช่น ยาฆ่าแมลงและสารกำจัดวัชพืช เนื่องจากสามารถปรับเปลี่ยนโครงสร้างเพื่อเพิ่มประสิทธิภาพในการออกฤทธิ์ได้อย่างมีประสิทธิภาพ อีกทั้งยังเป็นส่วนสำคัญในการวิจัยและพัฒนาสารเคมีใหม่ๆ ในห้องปฏิบัติการอีกด้วย