3-Fluoro-4-methylbenzonitrile ใช้หลักๆ เป็นสารกลาง (intermediate) ในสังเคราะห์อินทรีย์ โดยมีบทบาทสำคัญในการผลิตเภสัชภัณฑ์และสารเคมีเกษตร โครงสร้างที่มีอะตอมฟลูออรีนและกลุ่มไนไตรล์ทำให้มีคุณค่าต่อการปรับเปลี่ยนกิจกรรมทางชีวภาพของโมเลกุล มักใช้ในการพัฒนาสารออกฤทธิ์ทางเภสัชภัณฑ์ (APIs) โดยการนำฟลูออรีนเข้าไปช่วยเพิ่มความเสถียรทางเมแทบอลิซึมและ bioavailability นอกจากนี้ ยังเป็นบล็อกก่อสร้างในการสังเคราะห์สารกำจัดวัชพืชและยาฆ่าแมลง สนับสนุนการสร้างตัวแทนป้องกันพืชที่มีประสิทธิภาพสูงขึ้น ประโยชน์ในกระบวนการผลิตเคมีภัณฑ์ละเอียด (fine chemicals) เน้นย้ำความสำคัญในการพัฒนาวิทยาศาสตร์ทางการแพทย์และเกษตร