3,5-Difluoro-2-Methoxybenzonitrile เป็นสารเคมีที่ใช้หลักๆ เป็นสารกลาง (intermediate) ในการสังเคราะห์เภสัชภัณฑ์และสารเคมีเกษตร โดยมีบทบาทสำคัญในการพัฒนาสารออกฤทธิ์ สูตรโครงสร้างที่มีกลุ่มฟลูออรีนและเมทอกซี่ทำให้มีคุณค่ากในการสร้างโมเลกุลที่มีกิจกรรมทางชีวภาพเฉพาะเจาะจง มักใช้ในการผลิตสารกำจัดวัชพืชและสารกำจัดเชื้อรา ซึ่งคุณสมบัติเฉพาะตัวช่วยเพิ่มประสิทธิภาพของผลิตภัณฑ์สุดท้าย นอกจากนี้ยังเป็นสารตั้งต้นในปฏิกิริยาสังเคราะห์อินทรีย์ โดยเฉพาะในการสร้างสารประกอบอะโรมาติกซับซ้อนที่ใช้ในการค้นคว้าและพัฒนายา