3,5-Difluoro-4-methoxybenzonitrile เป็นสารเคมีที่ใช้ในการสังเคราะห์สารประกอบอินทรีย์ โดยเฉพาะในอุตสาหกรรมเภสัชกรรมและเคมีเกษตร มักถูกนำมาใช้เป็นสารตั้งต้นหรือสารกลางในการผลิตยาหรือสารเคมีกำจัดศัตรูพืช เนื่องจากโครงสร้างที่มีฟลูออรีนและหมู่เมทอกซีช่วยเพิ่มประสิทธิภาพและความเสถียรของผลิตภัณฑ์สุดท้าย นอกจากนี้ยังอาจใช้ในการวิจัยและพัฒนาเพื่อศึกษาปฏิกิริยาเคมีใหม่ๆ หรือปรับปรุงกระบวนการผลิตให้มีประสิทธิภาพมากขึ้น