2-Chloro-4-methoxybenzonitrile ใช้หลักในฐานะสารตั้งต้นในการสังเคราะห์สารเคมีเกษตรและเภสัชภัณฑ์ต่าง ๆ โดยมีบทบาทสำคัญในการผลิตสารกำจัดวัชพืชและยาฆ่าแมลง ซึ่งช่วยในการป้องกันพืชผลอย่างมีประสิทธิภาพและเพิ่มผลผลิตทางการเกษตร นอกจากนี้ ยังถูกนำมาใช้ในการพัฒนาสารประกอบเภสัชภัณฑ์บางชนิด โดยเฉพาะที่มุ่งเป้าไปยังเส้นทางเอนไซม์เฉพาะหรือกระบวนการทางชีวภาพ โครงสร้างทางเคมีของมันช่วยให้สามารถปรับแต่งเพิ่มเติมได้ ทำให้เป็นบล็อกก่อสร้างที่หลากหลายในการสังเคราะห์อินทรีย์