2-Fluoro-6-Nitrobenzonitrile ถูกนำมาใช้หลักๆ เป็นสารกลางในการสังเคราะห์อินทรีย์ โดยเฉพาะในการผลิตเภสัชภัณฑ์และเคมีเกษตร กลุ่มไนโตรและไซยาโนของมันทำให้เป็นบล็อกก่อสร้างที่หลากหลายสำหรับการสร้างโมเลกุลที่ซับซ้อนมากขึ้น ในเคมียารักษาโรค มันทำหน้าที่เป็นสารตั้งต้นสำหรับพัฒนาสารประกอบที่มีกิจกรรมทางชีวภาพที่เป็นไปได้ เช่น ตัวยับยั้งเอนไซม์หรือตัวปรับตัวรับ นอกจากนี้ ยังใช้ในการสังเคราะห์สารกำจัดวัชพืชและยาฆ่าแมลง ซึ่งโครงสร้างของมันช่วยเพิ่มประสิทธิภาพของผลิตภัณฑ์สุดท้าย อะตอมฟลูออรีนของมันช่วยเพิ่มความเสถียรและปฏิกิริยาของสารประกอบที่ได้จากมัน ทำให้มีคุณค่าในการผลิตเคมีภัณฑ์ละเอียด