2-Amino-4-bromo-6-fluorobenzonitrile ใช้ในการวิจัยเภสัชกรรมเป็นส่วนประกอบพื้นฐานสำหรับการสังเคราะห์โมเลกุลที่ซับซ้อน โดยเฉพาะในการพัฒนายาที่ขัดต่อโรคทางระบบประสาทและมะเร็ง โครงสร้างของมันช่วยให้สามารถปรับเปลี่ยนเพื่อเพิ่มกิจกรรมทางชีวภาพและความเลือกสรร นอกจากนี้ยังใช้ในการวิจัยเกษตรเคมีเพื่อสร้างสารที่มีศักยภาพในการเป็นยาฆ่าแมลงหรือสารกำจัดวัชพืช การมีอะตอมโบรมีนและฟลูออรีนทำให้เป็นสารกลางที่หลากหลายในการสังเคราะห์อินทรีย์ สามารถนำฮาโลเจนเหล่านี้เข้าไปในโครงสร้างที่ซับซ้อนมากขึ้นสำหรับการใช้งานต่างๆ เนื่องจากโครงสร้างที่ประกอบด้วยหมู่ฟังก์ชันที่หลากหลาย เช่น หมู่ไนไตรล์ หมู่แอมมิโน และหมู่ฮาโลเจน ทำให้มีความสำคัญในการปรับเปลี่ยนโครงสร้างทางเคมีเพื่อให้ได้สารที่มีคุณสมบัติเฉพาะทาง