ใช้เป็นสารตั้งต้นสำคัญในการสังเคราะห์สารเคมีเกษตรและเภสัชภัณฑ์ โดยเฉพาะในการพัฒนาสารกำจัดวัชพืชและสารกำจัดเชื้อรา เนื่องจากมีหมู่ฮาโลเจนและไนไตรล์ที่ทำปฏิกิริยาได้ โครงสร้างอะโรมาติกที่ถูกฟลูออรีนช่วยเพิ่มความเสถียรทางเมแทบอลิซึมและการดูดซึมทางชีวภาพในสารออกฤทธิ์ นอกจากนี้ยังใช้ในการเตรียมของเหลวผลึกและวัสดุอิเล็กทรอนิกส์อินทรีย์ ซึ่งต้องการหมู่ดึงอิเล็กตรอนเพื่อปรับเปลี่ยนคุณสมบัติทางอิเล็กทรอนิกส์ ใช้อย่างแพร่หลายในปฏิกิริยาการจับคู่ข้าม เช่น Suzuki หรือ Ullmann reactions เพื่อสร้างโมเลกุลฟลูออรีนที่ซับซ้อนในงานวิจัยและอุตสาหกรรม