ใช้เป็นสารตั้งต้นสำคัญในการสังเคราะห์ยา โดยเฉพาะในการพัฒนายับยั้งคินาสสำหรับการรักษามะเร็ง โครงสร้างของมันช่วยให้สามารถปรับเปลี่ยนได้อย่างเลือกสรร ทำให้มีคุณค่าในการสร้างส่วนประกอบยาที่มีฤทธิ์ทางเภสัชวิทยา (APIs) ที่มีประสิทธิภาพสูง นอกจากนี้ยังใช้ในอุตสาหกรรมเกษตรเคมีสำหรับการผลิตสารกำจัดวัชพืชและสารกำจัดเชื้อรา เนื่องจากมีหมู่ฟังก์ชันที่ทำปฏิกิริยาได้ วงแหวนอะโรมาติกที่ฟลูออรีนช่วยเพิ่มความเสถียรทางเมแทบอลิซึมในการออกแบบยา ทำให้ชีวเภสัชจลนศาสตร์ดีขึ้น ใช้กันทั่วไปในการวิจัยและพัฒนาสำหรับสารประกอบใหม่ในเคมียารักษาโรค