2-Bromo-5-fluorobenzonitrile ใช้เป็นสารตั้งต้นสำคัญในการสังเคราะห์อินทรีย์ โดยเฉพาะในการผลิตยาและสารเคมีเกษตร โครงสร้างที่มีหมู่บรอมและฟลูออโรทำให้เป็นบล็อกก่อสร้างที่หลากหลายสำหรับการสร้างโมเลกุลซับซ้อน โดยเฉพาะในการพัฒนาส่วนประกอบยาสำคัญ (APIs) นอกจากนี้ยังใช้ในการสังเคราะห์ผลึกเหลวและวัสดุขั้นสูง ซึ่งคุณสมบัติโครงสร้างช่วยให้ได้ลักษณะทางอิเล็กทรอนิกส์และแสงที่ต้องการ ในงานวิจัยยังใช้ศึกษาการแทนที่และออกแบบสารประกอบใหม่ที่มีหน้าที่เฉพาะ