4-(Difluoro-methanesulfonyl)-benzoic acid ใช้ในการสังเคราะห์สารเคมีที่มีความซับซ้อน โดยเฉพาะในกระบวนการผลิตยาและสารออกฤทธิ์ทางชีวภาพ เนื่องจากโครงสร้างที่มีทั้งกลุ่มซัลโฟนิลและกรดคาร์บอกซิลิก ทำให้เหมาะสำหรับการปรับเปลี่ยนโครงสร้างโมเลกุลเพื่อเพิ่มประสิทธิภาพของสารออกฤทธิ์ นอกจากนี้ ยังสามารถใช้เป็นสารตั้งต้นในปฏิกิริยาเคมีต่าง ๆ เช่น ปฏิกิริยาการเกิดพันธะคาร์บอน-คาร์บอน หรือคาร์บอน-เฮเทอโรอะตอม ซึ่งสำคัญในการพัฒนายาใหม่ ๆ และวัสดุที่มีคุณสมบัติเฉพาะทาง