กรด 3-คลอโร-4-ฟลูออโรเบนโซอิก ใช้หลัก ๆ เป็นสารกลางในการสังเคราะห์ยาและสารเคมีเกษตรต่าง ๆ โครงสร้างของมันช่วยให้ทำหน้าที่เป็นส่วนประกอบพื้นฐานในการผลิตส่วนผสมยาสำคัญ (APIs) และสารประกอบอินทรีย์ซับซ้อนอื่น ๆ มีคุณค่าอย่างยิ่งในการพัฒนายาที่มุ่งเป้าไปยังโรคเฉพาะ โดยการนำอะตอมฮาโลเจนเข้าไปช่วยเพิ่มกิจกรรมทางชีวภาพ นอกจากนี้ยังนำไปใช้ในการวิจัยและพัฒนาสารกำจัดวัชพืชและยาฆ่าแมลง เพื่อสนับสนุนการป้องกันพืชผลที่ดีขึ้น บทบาทในกระบวนการสังเคราะห์อินทรีย์ยังขยายไปสู่การสร้างสารเคมีพิเศษที่ใช้ในวัสดุขั้นสูงและกระบวนการอุตสาหกรรม