5-Fluoro-2-nitrobenzoic acid ใช้เป็นสารตั้งต้นในกระบวนการสังเคราะห์เภสัชภัณฑ์ต่างๆ โดยเฉพาะในการพัฒนาสารออกฤทธิ์ทางเภสัชกรรม (APIs) สำหรับยารักษาโรค มีบทบาทในกระบวนการสังเคราะห์อินทรีย์ โดยเฉพาะในการเตรียมสารประกอบไนโตรอะโรมาติก สารนี้ยังถูกนำมาใช้ในการวิจัยและพัฒนาเพื่อสร้างสารประกอบทางเคมีใหม่ที่มีศักยภาพทางชีวภาพ กลุ่มฟังก์ชันไนโตรและกรดคาร์บอกซิลิกทำให้เป็นบล็อกก่อสร้างที่หลากหลายสำหรับการดัดแปลงทางเคมีเพิ่มเติม นอกจากนี้ อาจถูกนำมาใช้ในการผลิตสีย้อม สารเคมีเกษตร และสารเคมีพิเศษอื่นๆ