กรด 3,4-ไดฟลูออโร-2-เมทอกซีเบนโซอิก ถูกใช้หลักly เป็นสารกลาง (intermediate) ในการสังเคราะห์สารประกอบเคมีที่ซับซ้อนมากขึ้น โดยมีบทบาทสำคัญในอุตสาหกรรมเภสัชกรรม ซึ่งนำไปใช้ในการพัฒนาสารออกฤทธิ์ทางเภสัชกรรม (APIs) โครงสร้างของมันที่มีทั้งกลุ่มฟลูออรีนและเมทอกซี ทำให้มีคุณค่าต่อการสร้างโมเลกุลที่มีกิจกรรมทางชีวภาพเฉพาะเจาะจง โดยเฉพาะในด้านการค้นพบยาและเคมียา นอกจากนี้ ยังถูกนำไปใช้ในการวิจัยสารเคมีเกษตรเพื่อออกแบบสารกำจัดวัชพืชหรือยาฆ่าแมลงใหม่ๆ โดยอาศัยคุณสมบัติทางเคมีที่เป็นเอกลักษณ์เพื่อเพิ่มประสิทธิภาพและความเลือกสรร สารประกอบนี้ยังถูกสำรวจในด้านวิทยาศาสตร์วัสดุสำหรับการพัฒนาโพลิเมอร์ขั้นสูงหรือสารเคลือบผิว ซึ่งกลุ่มอะโรมาติกและกลุ่มฟังก์ชันช่วยสนับสนุนลักษณะวัสดุที่ต้องการ