4-Bromo-2-fluoro-3-methoxybenzoic acid ถูกใช้เป็นหลักในการสังเคราะห์อินทรีย์ในฐานะสารกลางสำคัญในการผลิตสารประกอบเภสัชกรรมต่างๆ โครงสร้างของมันซึ่งมีหมู่แทนที่ bromo, fluoro และ methoxy ทำให้เป็นบล็อกก่อสร้างที่หลากหลายสำหรับการออกแบบโมเลกุลที่มีกิจกรรมทางชีวภาพเฉพาะเจาะจง มันมักถูกนำมาใช้ในการพัฒนายาที่มุ่งเป้าไปยังโรคทางระบบประสาท มะเร็ง และโรคอักเสบ เนื่องจากความสามารถในการปรับเปลี่ยนปฏิกิริยาระหว่างตัวรับและกิจกรรมของเอนไซม์ นอกจากนี้ สารประกอบนี้ยังถูกใช้ในการวิจัยเพื่อศึกษาความสัมพันธ์โครงสร้าง-กิจกรรม ช่วยในการปรับปรุงผู้สมัครยาเพื่อประสิทธิภาพและความเลือกสรรที่เพิ่มขึ้น การประยุกต์ใช้นี้ยังขยายไปยังการวิจัยเกษตรเคมี ที่ซึ่งมันทำหน้าที่เป็นสารตั้งต้นในการสังเคราะห์สารกำจัดวัชพืชและยาฆ่าแมลงที่มีประสิทธิภาพดีขึ้น