Methyl 4-bromo-2,3-difluorobenzoate ใช้หลักๆ เป็นสารกลางในกระบวนการสังเคราะห์อินทรีย์ โดยเฉพาะในการพัฒนายาและสารเคมีเกษตร โครงสร้างที่มีหมู่โบรโมและฟลูออโร ทำให้เป็นบล็อกก่อสร้างที่มีคุณค่าในการสร้างโมเลกุลที่ซับซ้อนมากขึ้น ในงานวิจัยเภสัชกรรม มักใช้ในการสังเคราะห์ส่วนประกอบยาสำคัญ (APIs) โดยที่อะตอมฮาโลเจนช่วยเพิ่มกิจกรรมทางชีวภาพหรือปรับปรุงความเสถียรของยา นอกจากนี้ ยังใช้ในการผลิตสารเคมีเกษตร เช่น ยาฆ่าหญ้าและยาฆ่าแมลง ซึ่งกลุ่ม difluoro และ bromo ช่วยเพิ่มประสิทธิภาพของผลิตภัณฑ์สุดท้าย บทบาทของมันในปฏิกิริยาครอส-คัปเปลิง เช่น Suzuki หรือ Buchwald-Hartwig ก็มีความสำคัญ ช่วยในการสร้างสารประกอบอะโรมาติกที่หลากหลายที่มีคุณสมบัติเฉพาะ