กรด 4-คลอโร-5-ไอโอโด-2-เมทอกซีเบนโซอิก ถูกนำมาใช้หลักในการสังเคราะห์อินทรีย์เป็นสารกลางที่หลากหลายสำหรับการเตรียมสารประกอบเคมีที่ซับซ้อนมากขึ้น โครงสร้างที่เป็นเอกลักษณ์ซึ่งมีทั้งหมู่แทนที่คลอโรและไอโอโด ทำให้มีคุณค่าต่อปฏิกิริยาการจับคู่ข้าม เช่น การจับคู่แบบซูซูกิหรือโซโนกาชิรา ซึ่งจำเป็นต่อการวิจัยทางเภสัชกรรมและเกษตรเคมี หมู่เมทอกซียังช่วยเพิ่มปฏิกิริยาของมัน อนุญาตให้มีการปรับแต่งแบบเลือกสรรในการสังเคราะห์โมเลกุลชีวภาพ นอกจากนี้ยังทำหน้าที่เป็นบล็อกก่อสร้างในการพัฒนาสีย้อม สีเม็ด และวัสดุที่มีคุณสมบัติทางแสงเฉพาะ การประยุกต์ใช้ของมันโดดเด่นเป็นพิเศษในเคมียารักษาโรค ซึ่งมีส่วนช่วยในการสร้างผู้สมัครยาที่มีศักยภาพในการกำหนดเป้าหมายโรคต่างๆ