ใช้ในการสังเคราะห์สารประกอบทางเภสัชภัณฑ์ โดยเฉพาะในการพัฒนายาโมเลกุลขนาดเล็กที่มุ่งเป้าไปยังเส้นทางชีวภาพเฉพาะเจาะจง ทำหน้าที่เป็นสารกลางสำคัญในการผลิตส่วนประกอบยาสำคัญ (APIs) ที่มีศักยภาพในการบำบัด เช่น สารต้านการอักเสบหรือต้านมะเร็ง กลุ่มไตรฟลูออโรเมทิลช่วยเพิ่มความเสถียรทางเมแทบอลิซึมและการดูดซึมทางชีวภาพ ทำให้มีคุณค่าในการออกแบบยา โครงสร้างธิโอฟีน-3-อิลช่วยเสริมคุณสมบัติโครงสร้างที่เป็นเอกลักษณ์สำหรับปฏิกิริยาชีวภาพ นอกจากนี้ ยังใช้ในการวิจัยเคมีอินทรีย์เพื่อศึกษาความสัมพันธ์โครงสร้าง-กิจกรรม (SAR) ในโครงการเคมีเภสัชกรรม