ใช้เป็นสารตั้งต้นสำคัญในการสังเคราะห์สารประกอบทางเภสัชกรรม โดยเฉพาะในการพัฒนายับยั้งโปรติเอส (protease inhibitors) และโมเลกุลชีวภาพอื่นๆ กลุ่มฟังก์ชันของมันช่วยให้สามารถทำการจับคู่เปปไทด์แบบเลือกสรรและกลยุทธ์การป้องกันในกระบวนการสังเคราะห์อินทรีย์หลายขั้นตอน ได้รับการใช้อย่างแพร่หลายในเคมีทางการแพทย์เพื่อสร้างอนุพันธ์กรดอะมิโนที่ซับซ้อนและเปปไทโดมิมเมติกส์ (peptidomimetics) กลุ่มอะมีนที่ได้รับการป้องกันด้วย Boc ให้ความเสถียรระหว่างปฏิกิริยาและสามารถถอดการป้องกันได้ภายใต้สภาวะกรดอ่อน ทำให้มีคุณค่าต่อการสังเคราะห์เปปไทด์แบบเฟสแข็งและแบบสารละลาย นอกจากนี้ยังใช้ในการเตรียมผู้สมัครยาที่เล็งเป้าไปยังการติดเชื้อไวรัสและความผิดปกติทางเมแทบอลิซึม