ใช้ในกระบวนการสังเคราะห์สารประกอบทางเคมีที่ต้องการควบคุมการตอบสนองของหมู่ฟังก์ชัน โดยเฉพาะในงานสังเคราะห์เปปไทด์และสารออกฤทธิ์ทางชีวภาพ เนื่องจากหมู่ tert-Butoxycarbonyl (Boc) ทำหน้าที่เป็นหมู่ป้องกันหมู่อะมิโน ช่วยป้องกันไม่ให้เกิดปฏิกิริยาที่ไม่ต้องการระหว่างกระบวนการสังเคราะห์ หลังจากนั้นสามารถถอดหมู่ Boc ออกได้ง่ายภายใต้สภาวะกรดอ่อน ๆ เพื่อให้ได้ผลิตภัณฑ์สุดท้ายที่ต้องการ เหมาะสำหรับใช้ในสังเคราะห์ยาหรือสารตั้งต้นที่ต้องการความบริสุทธิ์สูง