กรด 2,4-ไดฟลูออโร-3-เมทอกซีเบนโซอิก ใช้หลักly เป็นสารกลางในการสังเคราะห์สารประกอบทางเภสัชกรรมต่างๆ โครงสร้างของมันซึ่งมีทั้งกลุ่มฟลูออรีนและเมทอกซี ทำให้เป็นส่วนประกอบที่มีคุณค่าต่อการพัฒนาสารออกฤทธิ์ทางเภสัชกรรม (APIs) มักใช้ในการผลิตยาที่มุ่งเป้าไปยังเส้นทางชีวภาพเฉพาะ โดยเฉพาะในการสร้างโมเลกุลที่มีการดูดซึมทางชีวภาพและความเสถียรทางเมแทบอลิซึมที่เพิ่มขึ้น นอกจากนี้ สารประกอบนี้ยังถูกนำมาใช้ในการวิจัยสารเคมีเกษตรสำหรับการพัฒนายาฆ่าหญ้าและยาฆ่าแมลง ซึ่งคุณสมบัติทางเคมีที่เป็นเอกลักษณ์ช่วยเพิ่มประสิทธิภาพของผลิตภัณฑ์สุดท้าย ความหลากหลายในการสังเคราะห์อินทรีย์ยังขยายไปสู่ศาสตร์วัสดุศาสตร์ ซึ่งสามารถนำไปรวมในการออกแบบโพลิเมอร์และสารเคลือบขั้นสูง