ใช้เป็นสารตั้งต้นในการสังเคราะห์สารประกอบที่มีโครงสร้างพิเพอราซีน ซึ่งมักพบในยาที่ออกฤทธิ์ต่อระบบประสาทส่วนกลาง โดยเฉพาะในงานวิจัยและพัฒนายาที่เกี่ยวข้องกับโรคทางจิตเวช เช่น ภาวะซึมเศร้า วิตกกังวล หรือโรคจิต โครงสร้างเบนโซฟูแรนและพิเพอราซีนที่มีอยู่ช่วยให้สารนี้มีศักยภาพในการจับกับตัวรับในสมอง เช่น ตัวรับเซโรโทนินหรือโดพามีน จึงนิยมใช้ในขั้นตอนการคัดเลือกสารต้นแบบ (lead compound) สำหรับการพัฒนายาใหม่ นอกจากนี้ยังใช้ในงานเคมีอินทรีย์เพื่อสร้างสารอนุพันธ์ที่มีความเฉพาะเจาะจงสูงผ่านปฏิกิริยาต่อเนื่อง เช่น การแทนที่ การตัดหมู่ป้องกัน หรือการสร้างพันธะคาร์บอน-คาร์บอน