(5-Cyanobenzofuran-2-yl)boronic acid ใช้ในกระบวนการสังเคราะห์สารอินทรีย์ โดยทำหน้าที่เป็นสารตั้งต้นสำคัญในการเตรียมยา สารเคมีทางการเกษตร และวัสดุอิเล็กทรอนิกส์ โดยเฉพาะในปฏิกิริยา Suzuki-Miyaura cross-coupling ซึ่งช่วยในการสร้างพันธะคาร์บอน-คาร์บอนระหว่างสารประกอบอะโรมาติก เพื่อสร้างโมเลกุลที่ซับซ้อน นอกจากนี้ยังใช้ในการพัฒนาโพรบเรืองแสงและเซ็นเซอร์ เนื่องจากสามารถโต้ตอบกับเป้าหมายทางชีวภาพเฉพาะเจาะจง กลุ่ม boronic acid ยังมีประโยชน์ในการจดจำและจับคาร์โบไฮเดรต ซึ่งเกี่ยวข้องกับการวิจัยทางชีวเคมีและการวินิจฉัย นอกจากนี้ยังมีบทบาทในการวิจัยและพัฒนายาใหม่ ๆ โดยเป็นส่วนหนึ่งของโมเลกุลเป้าหมายในการออกแบบและทดสอบฤทธิ์ทางชีวภาพ