6-Chlorobenzo[d][1,3]dioxol-5-amine เป็นสารประกอบที่นำมาใช้หลัก ๆ ในงานวิจัยและพัฒนายา โดยเฉพาะในการสังเคราะห์โมเลกุลอินทรีย์ที่ซับซ้อน สารนี้ทำหน้าที่เป็นสารกลางสำคัญในการสร้างตัวแทนบำบัดต่าง ๆ รวมถึงยาที่มุ่งเป้าไปที่โรคทางระบบประสาทและจิตเวช คุณสมบัติทางโครงสร้างของมันทำให้มีคุณค่าในการสร้างสารประกอบที่มีกิจกรรมทางชีวภาพเฉพาะเจาะจง ซึ่งมักถูกสำรวจในโปรแกรมค้นพบยา นอกจากนี้ ยังถูกนำมาใช้ในการศึกษาทางเคมีเพื่อตรวจสอบกลไกปฏิกิริยาและพัฒนาเส้นทางสังเคราะห์ใหม่ ๆ การประยุกต์ใช้ส่วนใหญ่จำกัดอยู่ในห้องปฏิบัติการ ซึ่งช่วยส่งเสริมความก้าวหน้าในเคมียารักษาและการสังเคราะห์อินทรีย์