5,6-Dichlorobenzo[d][1,3]dioxole มักถูกนำไปใช้ในการวิจัยทางเคมีและชีวเคมีเพื่อศึกษาปฏิกิริยาและกลไกการทำงานของสารเคมีที่มีโครงสร้างคล้ายคลึงกัน นอกจากนี้ยังอาจถูกใช้เป็นสารตั้งต้นหรือสารกลางในการสังเคราะห์สารเคมีอื่นๆ ที่มีความซับซ้อนมากขึ้น โดยเฉพาะในกระบวนการผลิตยาและสารกำจัดศัตรูพืช เนื่องจากโครงสร้างของมันสามารถเป็นพื้นฐานในการพัฒนาสารที่มีฤทธิ์ทางชีวภาพได้